Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SktA2AQ25 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms