Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtf1A2AQ19 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms