Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll9A2APC3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll9A2APC3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms