Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms