Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms