Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms