Protein–RNA interactions for Protein: A2AEU1

Mcf2, Mcf.2-transforming sequence, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2A2AEU1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mcf2A2AEU1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcf2A2AEU1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms