Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc39aA2ACP1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms