Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myom3A2ABU4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms