Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trav12-2A0N8N6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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