Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms