Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms