Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms