Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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