Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms