Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms