Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3550W4VSN7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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