Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms