Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms