Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdpk1Q9Z2A0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms