Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn6Q9Z262 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn6Q9Z262 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn6Q9Z262 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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