Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl27Q9Z1X0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ccl27Q9Z1X0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccl27Q9Z1X0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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