Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfkbiaQ9Z1E3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfkbiaQ9Z1E3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms