Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms