Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katna1Q9WV86 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms