Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4b1Q9WV76 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ap4b1Q9WV76 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ap4b1Q9WV76 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ap4b1Q9WV76 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ap4b1Q9WV76 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4b1Q9WV76 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ap4b1Q9WV76 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms