Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms