Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnip1Q9WUU8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnip1Q9WUU8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms