Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms