Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc2Q9R244 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms