Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sept6Q9R1T4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sept6Q9R1T4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms