Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms