Protein–RNA interactions for Protein: Q9R100

Cdh17, Cadherin-17, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh17Q9R100 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh17Q9R100 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms