Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms