Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms