Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod2Q9R0B9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod2Q9R0B9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms