Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc3Q9R0B6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms