Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AmfrQ9R049 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms