Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsjQ9R014 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms