Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms