Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rnf4Q9QZS2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf4Q9QZS2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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