Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms