Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a3Q9QZB6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms