Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt3Q9QZ47 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms