Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms