Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic4Q9QYB1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic4Q9QYB1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms