Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tomm40Q9QYA2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms