Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hacd1Q9QY80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms