Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp3Q9QY23 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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