Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx8Q9QXV1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms